Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMPHP49418 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMPHP49418 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMPHP49418 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMPHP49418 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMPHP49418 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms