Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms