Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC19A1P41440 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms