Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDH1P40925 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDH1P40925 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms