Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms