Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms