Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms