Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMBRP28336 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMBRP28336 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms