Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms