Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AL512274.1-201ENST00000562471 2027 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms