Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1P23471 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms