Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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