Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XBP1P17861 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XBP1P17861 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XBP1P17861 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XBP1P17861 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XBP1P17861 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XBP1P17861 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XBP1P17861 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XBP1P17861 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XBP1P17861 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XBP1P17861 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XBP1P17861 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XBP1P17861 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XBP1P17861 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XBP1P17861 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XBP1P17861 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XBP1P17861 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XBP1P17861 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XBP1P17861 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XBP1P17861 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XBP1P17861 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XBP1P17861 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XBP1P17861 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XBP1P17861 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XBP1P17861 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms