Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRG2P13727 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRG2P13727 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRG2P13727 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms