Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEPDP12955 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PEPDP12955 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PEPDP12955 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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PEPDP12955 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PEPDP12955 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEPDP12955 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PEPDP12955 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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