Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF1P05230 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF1P05230 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF1P05230 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms