Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH16O75452 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH16O75452 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH16O75452 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH16O75452 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH16O75452 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH16O75452 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH16O75452 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH16O75452 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH16O75452 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms