Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSVO60911 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms