Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABRPO00591 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABRPO00591 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABRPO00591 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GABRPO00591 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABRPO00591 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABRPO00591 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABRPO00591 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABRPO00591 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms