Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CLDN34H7C241 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN34H7C241 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN34H7C241 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN34H7C241 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN34H7C241 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN34H7C241 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN34H7C241 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN34H7C241 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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