Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNRNPCL3B7ZW38 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms