Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms