Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144AA2RUR9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms