Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms