Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM35Q9UPQ4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM35Q9UPQ4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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