Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms