Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms