Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms