Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms