Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms