Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms