Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCM2LQ9NUG4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms