Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6BQ9NRW1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms