Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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NRIP3Q9NQ35 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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NRIP3Q9NQ35 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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NRIP3Q9NQ35 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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