Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms