Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms