Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms