Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSTA2-201ENST00000493422 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARPC3-201ENST00000228825 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF738-202ENST00000380870 1142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 IP6K2-208ENST00000417896 1124 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BMS1P12-201ENST00000428213 706 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCAIM-208ENST00000444602 1056 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NFRKB-205ENST00000526940 539 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC137735.1-201ENST00000581911 419 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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