Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms