Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms