Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPOQ9BU64 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms