Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms