Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms