Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms