Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms