Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms