Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms