Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL2Q969S2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms