Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROX1Q92786 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX1Q92786 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms