Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms